Открывающаяся 5 мая 2010 г. выставка – история о том, как сражался и побеждал в годы войны музей, в основе создания которого лежали идеи гуманизма и мирного сосуществования представителей разных религий (до 1954 г . - Музей истории религии (МИР).

В годы Великой Отечественной войны основная экспозиция музея, находившегося тогда в Казанском соборе, была свёрнута. Экспонаты хранились в подвалах Исаакиевского собора. Однако музей продолжал свою научную и выставочную деятельность.

Те немногочисленные сотрудники, которые не ушли на фронт, поддерживали сохранность музейных коллекций, дежурили на крыше, тушили зажигательные бомбы. Они находили в себе силы заниматься исследовательской деятельностью; работать над созданием новых выставок, посвященных военно-историческому прошлому. Этим людям, героически прошедшим испытания военных лет, посвящена новая выставка.

На ней представлены документы, свидетельствующие о повреждении Казанского собора во время артобстрелов, выдержки из книги отзывов о посещении выставок музея бойцами перед отправкой на фронт, запросы из госпиталей о проведении выставок и чтении лекций перед раненными бойцами, фотографии, иллюстрирующие повседневную жизнь музея 1941 – 1945 гг. Посетителям будет интересен фонарик, выпущенный на заводе «Электросила» в 1941 году, работающий и сейчас, кусочек блокадного хлеба и детская игрушка, пережившая блокаду в семье ленинградцев. Отдельно будут представлены научные труды, написанные сотрудниками, участниками Великой Отечественной войны.